Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GFRA4Q9GZZ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFRA4Q9GZZ7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms