Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12CQ9C0D7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12CQ9C0D7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms