Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM3Q9BZL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms