Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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