Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTDSS2Q9BVG9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms