Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPOQ9BU64 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms