Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM43Q9BTV4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM43Q9BTV4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms