Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EBF4Q9BQW3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms