Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD3

KXD1, KxDL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KXD1Q9BQD3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KXD1Q9BQD3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KXD1Q9BQD3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms