Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TREX2Q9BQ50 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TREX2Q9BQ50 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms