Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI9

CXorf58, Putative uncharacterized protein CXorf58, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf58Q96LI9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXorf58Q96LI9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXorf58Q96LI9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms