Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms