Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms