Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms