Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms