Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRUQ92729 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRUQ92729 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms