Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3RF3Q8TEJ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms