Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG8Q8ND04 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms