Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HJURPQ8NCD3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms