Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC155Q8N6L0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms