Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSL3Q8N5Y2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSL3Q8N5Y2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms