Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHCHD4Q8N4Q1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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