Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC71Q8N4P6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms