Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC170Q8IYT3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC170Q8IYT3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms