Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLFN12Q8IYM2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLFN12Q8IYM2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms