Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC50Q8IVM0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms