Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR49Q8IV35 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms