Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y39

NDUFA11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA11Q86Y39 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NDUFA11Q86Y39 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA11Q86Y39 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms