Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMC6Q7Z403 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMC6Q7Z403 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms