Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA2D4Q7Z3S7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms