Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP50Q70EL3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP50Q70EL3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP50Q70EL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP50Q70EL3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP50Q70EL3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms