Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms