Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms