Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms