Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KANK3Q6NY19 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms