Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RWDD4Q6NW29 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RWDD4Q6NW29 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms