Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GGNBP1Q5YKI7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GGNBP1Q5YKI7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms