Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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LRRC38Q5VT99 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC38Q5VT99 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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