Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPANXN1Q5VSR9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN1Q5VSR9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms