Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RSPH4AQ5TD94 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RSPH4AQ5TD94 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms