Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms