Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HABP4Q5JVS0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms