Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCID2Q5JVF3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms