Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC178Q5BJE1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC178Q5BJE1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms