Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SDK2Q58EX2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SDK2Q58EX2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms