Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms