Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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KRTAP21-1Q3LI58 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
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KRTAP21-1Q3LI58 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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KRTAP21-1Q3LI58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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KRTAP21-1Q3LI58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KRTAP21-1Q3LI58 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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KRTAP21-1Q3LI58 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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KRTAP21-1Q3LI58 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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KRTAP21-1Q3LI58 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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KRTAP21-1Q3LI58 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP21-1Q3LI58 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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