Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRFIP1Q32MZ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms