Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT3

CLEC16A, Protein CLEC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC16AQ2KHT3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC16AQ2KHT3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLEC16AQ2KHT3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms