Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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